Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL10A1Q03692 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms