Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PLCB3Q01970 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLCB3Q01970 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms