Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MS4A2Q01362 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms