Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms