Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms