Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA2P62736 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms