Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P62684 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms