Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms