Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ACTBP60709 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ACTBP60709 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ACTBP60709 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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