Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms