Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCCD1P59942 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms