Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIK1P57059 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK1P57059 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK1P57059 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK1P57059 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIK1P57059 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms