Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN8P56748 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN8P56748 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms