Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGGT1BP53609 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms