Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms