Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms