Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AFMP43652 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AFMP43652 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AFMP43652 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AFMP43652 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms