Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms