Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV3P41162 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV3P41162 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV3P41162 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV3P41162 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV3P41162 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV3P41162 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV3P41162 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV3P41162 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms