Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGAEP38570 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGAEP38570 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGAEP38570 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGAEP38570 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ITGAEP38570 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ITGAEP38570 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGAEP38570 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms