Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms