Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF4P34130 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms