Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCKARP32238 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCKARP32238 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCKARP32238 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms