Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA5P31644 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA5P31644 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms