Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP1P30622 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms