Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TSPOP30536 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TSPOP30536 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TSPOP30536 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TSPOP30536 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TSPOP30536 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TSPOP30536 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TSPOP30536 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TSPOP30536 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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