Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms