Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms