Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRGP23470 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRGP23470 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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