Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NF1P21359 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NF1P21359 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NF1P21359 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NF1P21359 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NF1P21359 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NF1P21359 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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NF1P21359 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NF1P21359 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NF1P21359 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NF1P21359 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NF1P21359 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NF1P21359 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NF1P21359 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NF1P21359 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NF1P21359 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NF1P21359 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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