Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPI1P17947 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPI1P17947 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms