Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms