Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA1P02647 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA1P02647 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA1P02647 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA1P02647 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms