Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-HP01893 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms