Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF1O95521 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms