Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD4O95243 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD4O95243 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD4O95243 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms