Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP19O94966 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP19O94966 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP19O94966 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP19O94966 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP19O94966 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP19O94966 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms