Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SURF6O75683 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SURF6O75683 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SURF6O75683 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SURF6O75683 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SURF6O75683 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SURF6O75683 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms