Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA4O75676 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA4O75676 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms