Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms