Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms