Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXA3O43365 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXA3O43365 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXA3O43365 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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