Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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