Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCBPO00560 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCBPO00560 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms