Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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