Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms