Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KR12 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KR12 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KR12 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KR12 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms