Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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