Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms