Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms